1、主体结构：
主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝，从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固，线条简明，美观大方，密封性好。
2、标准的三区分隔和气压调节：
将PCR过程分成试剂准备、标本制备和PCR扩增检测三个独立的实验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区，同时各区通过气压调节，使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。
可打开缓冲区Ⅰ，缓冲区Ⅱ和 PCR 扩增区的排风扇往外排气，在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口，空气通过回风口向室内换气。
3、 消毒：
在三个实验区和三个缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯，供消毒用。在试剂准备区和标本制备区 还设置移动紫外线灯，对实验桌进行局部消毒。
4、机械连锁不锈钢传递窗：
试剂和标本通过机械连锁不锈钢（不建议使用电子连锁方式）传递窗传递，保证试剂和标本在传递过程中不受污染（人物分流）
5、 地面
地面建议使用PVC卷材地面或自流坪地面，整体性好。便于进行清扫，耐腐蚀。没有条件的也可采用水磨石地面，或大块的瓷砖（至少800mm×800mm）接缝需要小于2mm。
6、照明
灯具要选用净化灯具，能达到便于清洗、不积尘的特点。
1.实验室空调通风系统设计及压力控制
PCR实验室并没有严格的净化要求，但是为避免各个实验区域间交叉污染的可能性，宜采用全送全排的气流组织形式。同时，要严格控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
2.污染的预防与控制
PCR实验室设计的问题是如何避免污染。在实际工作中，常见的有以下几种污染类型：扩增产物的污染；天然基因组DNA的污染；试剂的污染以及标本间的污染。由于一旦发生污染，实验就必须停止，直到找到污染源为止，而且实验结果必须作废，需重新进行实验。所以发生污染后再围绕实验室来寻找污染源不但耗时而且繁琐，浪费人力物力。因此要避免污染，首先应是预防，而不是排除。
在一般情况下，高粉尘含量会致使干净度降低，而低粉尘含量容易导致洁净度。在净化车间的建设合同中，通常只会基本的空状态测试，而因时间紧迫，经常错过静态和动态测试。但仍建议承建商和业主在静态和动态条件下都对净化车间进行测试。可有效保证净化车间的建造符合相关设计要求。在静态和动态两种不同条件下的测试结果对比，分析净化车间存在的问题，并提供有效帮助。例如：在静态条件下，洁净度达标，但到了动态条件下，却超标。
因净化车间管理措施发生失误而致使：安装机器时，不标准的清洁，不恰当的清洁程序，不严格的纪律管理，不正确的机器放置位置（将回风口挡住，或对过滤器的送风阻断）等。因此，建议在空态和动态时，都要对净化车间进行测试。
所有的净化车间测试，基本都是基于国际认可标准上。 这些标准和实践为净化工厂的测试和认证提供了基本指导。事实上，净化车间的业主和承建商因产品，工艺要求对技术指标，测试方式，验收标准有着不同协议。因此，很多验收标准由净化车间的业主和承建商通过协商，并参考净化车间测试认证公司的建议达成协议。
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