负压隔离病房的特殊性在于它是“隔离” 的病房，且“ 隔离”是处于“ 负压” 的状态下。且病房要求相对密闭、舒适、洁净，具备 ICU 病房的抢救功能。其设计复杂，施工难度大 , 投资及运行维护费用高 。
1、功能分区
为了确保负压隔离病房的“隔离” 实现，负压隔离病房要采取严格的功能分区和流程，医护人员、、物流都必须按照单向流程活动。医护人员与 、清洁物资和污染物品都有各自的独立出入口和严格的流经路线 。负压隔离病房按功能要求设置四个区域：工作人员生活区(清洁区) 、工作区（半污染区）、病房区（污染区）、设备区（空调排风机房）。并要求按“ 五室二缓” 来进行建筑平面布局。各区既独立又相连接，连接处设缓冲区，并由隔离门进行隔离 。
2、负压差 、定向流 、压力梯度
在进行合理分区的基础上，就要进一步采取措施使隔离病房处于“负压”的状态，使各区之间形成一定的负压差，既让污染区的空气压力低于非污染区的空气压力，空气经有序的气流组织 一一定向流，按一定压力梯度，经清洁区、半污染区、污染区再经有效过滤、消毒后排至室外。使病区外的地方不会被污染，保护医务人员免受 。
3、全新风运行
根据需要负压隔离病房要采取大新风比直至全新风的运行方式，以适合SARS、甲型等性强的呼吸道疾病 。
负压病房建设和设计必须遵循一些原则：
（1）安全可靠原则：系统运行于负压病房，牵涉到患者的生命安全，系统的安全可靠性必须放在首位，硬件尽量避免出现故障，如果出现故障，负压病房中，系统必须有相应报警及应急措施，对于各种可能出现的特殊情况均需考虑在内。
负压病房是通过净化空调系统提供一定洁净等级的环境，为极度低下的患者提供、恢复的有生物洁净功能的病房。润德净化表示，负压病房净化过程中，应为患者休息、营造舒适、洁净、安全的空气环境。
特别是移植病房，患者在无菌环境下的周期一般为1~2个月甚至更长，负压病房净化中需要充分考虑室内环境的重要性，包括室内温湿度、空气流速、空气品质、室内用品的舒适方便、室内装饰材料的质感和色彩、患者视野开阔性、患者与亲属交流的探视窗等。
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